ENCEFALITIS
Se clasifican en dos grandes grupos según la naturaleza del exudado:
 - No purulentas: cuando no hay leucocitos granulocíticos.
 - Purulentas: si hay leucocitos granulocíticos.
Encefalitis no purulentas.
La etiología es vírica salvo algunas excepciones y las lesiones macroscópicas son mínimas o están ausentes. Las microscópicas son características y constituyen lo se conoce como reacción encefalítica:

a) Degeneración neuronal
b) Reacción glial
c) Manguitos perivasculares
d) Otros cambios
a) Degeneración neuronal. La localización de estas alteraciones puede ser hasta cierto punto específica pero las lesiones son inespecíficas, y la intensidad y extensión varían mucho.
Estas lesiones son:
 - Cromatolisis central que progresa a total con desplazamiento del núcleo a la periferia y posterior picnosis, cariorrexis y cariolisis.
 - Neuronas coaguladas (arrugadas y acidófilas), normalmente presentes pero presentes en mayor número, son las únicas que estimulan la neuronofagia llevada a cabo por las células de glia.
 - Junto a neuronas degeneradas hay neuronas sanas.

b
) Gliosis. La proliferación de las células de glia en la reacción encefalítica se forma casi exclusivamente de la microglia y puede ser difusa o focal, siendo esta última la más característica. Un ejemplo son los cuerpos de Babes en la rabia. Los focos son de 10 células como máximo, si hay más participan también linfocitos y/o células plasmáticas. Se pueden observar tanto en la sustancia gris como en la blanca.
Los nódulos de microglia alrededor de neuronas degeneradas se denominan nódulos neuronofágicos.

c
) Manguitos perivasculares. Consisten en la acumulación de células en la pared de los vasos (particularmente arterias) y en el espacio de Virchow-Robin. Las células suelen ser linfocitos pero, en las fases iniciales, puede haber leucocitos granulocíticos que desaparecen rápidamente, y, pasada una semana, se agregan macrófagos y células plasmáticas.
Los manguitos perivasculares no son exclusivos de las infecciones víricas ya que tambien se forman en otros procesos degenerativos o inflamatorios.

d
) Otros cambios. A veces son las lesiones más características de la enfermedad. Se pueden observar:

 - Degeneración de los oligodendrocitos en el foco inflamatorio lo que conlleva distintos grados de desmielinización. Es particularmente importante en el Moquillo del perro, en la Leucoencefalomielitis de la cabra, en el Visna de las ovejas y en la Encefalitis de los perros viejos.

 - Espongiosis (vacuolización). Es característica en las denominadas Encefalopatias enpongiformes (Tembladera o Scrapie, Encefalopatia espongiforme bovina, Encefalopatia esponjiforme felina) que comprenden afecciones transmisibles, inoculables, degenerativas progresivas y crónicas que comportan lesiones microscópicas degenerativas del SNC caracterizadas por vacuolización neuronal junto con astrocitosis y vacuolización de la sustancia gris y blanca, con localizaciones preferenciales.
La identidad completa y precisa del agente responsable es bastante controvertida: A.T.T. (agente de transmisión de la Tembladera), agente de transmisión no convencional, Prion (partícula infecciosa proteinacea), virino (Prion + ácido nucleico), virus filamentoso, etc.

 - Lesiones en la pared de los vasos. Son secundarias a la acción directa del agente infeccioso y pueden ser cambios hialinos o fibrinoides como en la Fiebre catarral maligna o en la Encefalomielitis equina, o lesiones selectivas en las células endoteliales como en la Hepatitis vírica canina y Peste porcina clásica.

 - Y cuerpos de inclusión, presentes en algunas enfermedades, y que se pueden formar en las neuronas, la neurogia (astrocitos y oligodendrocitos) y en la microglia. Suelen ser acidófilos y pueden ser intranucleares, intracitoplasmáticos o ambos. Los más conocidos son:
 
 
- Los cuerpos de Negri, en la rabia, acidófilos e intracitoplasmáticos, preferentemente en el asta de Amon y en otras localizaciones.
 
- Los cuerpos de Joest-Degen, en la Enfermedad de Borna, intranucleares y, excepcionalmente en el citoplasma, preferentemente en neuronas del asta de Amon.
 
- Cuerpos de Lentz, en el moquillo, inclusiones acidófilas intranucleares e intracitoplasmáticas en neuronas motoras.

 - En la Enfermedad de Aujeszky en el cerdo, pequeñas inclusiones acidófilas en el núcleo de neuronas y astrocitos.

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